Secventiere_ITS_16S – Ala Biolab

Identificare bacteriană și fungică prin secvențiere 16S și ITS

ALA BIOLAB oferă servicii complete de identificare moleculară pentru izolate bacteriene și fungice. În funcție de materialul biologic furnizat, serviciul poate include extracția ADN, amplificarea markerului molecular, verificarea și purificarea ampliconului, secvențierea Sanger bidirecțională, analiza bioinformatică și raportarea rezultatului.

Identificare bacteriană prin secvențiere 16S rRNA

Identificarea bacteriană se realizează prin amplificarea și secvențierea unei regiuni a genei 16S rRNA.

Serviciul include, în funcție de formatul probei:

extracția ADN din cultură bacteriană pură;

amplificarea markerului 16S rRNA;

verificarea și purificarea produsului PCR;

secvențierea Sanger bidirecțională;

compararea secvenței prin BLAST cu baze de date de referință;

raportarea identificării taxonomice și a gradului de similaritate.

Analiza este recomandată pentru izolate bacteriene pure.

Identificare fungică prin secvențiere ITS

Identificarea fungică se realizează prin amplificarea și secvențierea regiunii ITS.

Serviciul este potrivit pentru drojdii și fungi filamentoși și poate include:

extracția ADN din cultură fungică pură;

amplificarea regiunii ITS;

verificarea și purificarea produsului PCR;

secvențierea Sanger bidirecțională;

compararea secvenței prin BLAST cu baze de date de referință;

raportarea identificării taxonomice și a gradului de similaritate.

De la probă la raport

Probă → Extracție ADN → PCR 16S/ITS → Verificare pe gel → Purificarea ampliconului → Secvențiere Sanger → Analiză bioinformatică → Raport final de identificare

BITseq™ in comparație cu Sanger

BITseq™ in comparație cu Sanger

Formate de probă acceptate

Cultură pură

Colonie sau pelet provenit dintr-o cultură bacteriană ori fungică pură.

ADN genomic

ADN extras și pregătit pentru amplificarea markerului 16S sau ITS.

Amplicon PCR

Produs PCR unic, furnizat pentru purificare și/sau secvențiere Sanger.

Servicii și tarife

Identificare din cultură pură – 350 lei/probă

Include extracția ADN, PCR 16S/ITS, verificarea pe gel, purificarea ampliconului, secvențierea Sanger, analiza BLAST și raportul final.

Identificare din ADN genomic – 250 lei/probă

Include PCR 16S/ITS, verificarea pe gel, purificarea ampliconului, secvențierea Sanger, analiza BLAST și raportul final.

Identificare din amplicon PCR – 100 lei/probă

Include purificarea ampliconului, secvențierea Sanger, analiza BLAST și raportul final.

Secvențiere Sanger bidirecțională – 70 lei/probă

Include două reacții Sanger pentru ampliconul furnizat și livrarea datelor rezultate.

Prețurile nu includ TVA. Termenul estimativ de procesare este de 5–7 zile lucrătoare. Pentru minimum 10 probe sunt disponibile condiții comerciale speciale.

Rezultate furnizate

În funcție de serviciul selectat, livrabilele pot include:

fișierele brute de secvențiere în format .ab1;

secvențele procesate;

rezultatele analizei BLAST;

raportul PDF cu identificarea taxonomică și gradul de similaritate.

Informații importante

Pentru identificare este necesară o cultură pură sau un amplicon PCR unic. Probele mixte pot produce secvențe suprapuse și rezultate neconcludente.

Rezoluția taxonomică depinde de markerul analizat, de calitatea secvenței și de reprezentarea organismului în bazele de date de referință. Pentru anumite grupuri, identificarea la nivel de specie poate necesita analiza unor markeri moleculari suplimentari.

Nu acceptăm probe biologice umane și nici probe despre care există informații sau suspiciuni că ar conține microorganisme patogene. Serviciul este destinat exclusiv activităților de cercetare. Rezultatele nu reprezintă un diagnostic clinic și nu sunt emise în regim de analiză acreditată.

Cere oferta!