Untitled
tele1
mail1
Servicii de secventiere Oxford Nanopore (ONT)*
  • *Serviciile sunt oferite de ALA BIOLAB, în parteneriat cu Microsynth (laborator de referință european).
  • Prezentare generală
  • Microsynth a adoptat timpuriu tehnologia Oxford Nanopore Technologies (ONT) și a acumulat peste 7 ani de experiență în livrarea de servicii bazate pe secvențiere long-read. Portofoliul de servicii acoperă o gamă largă de aplicații, de la izolarea ADN/ARN până la analize bioinformatice avansate, adaptate cerințelor proiectelor de cercetare.
  • Microsynth oferă două categorii distincte de servicii ONT:
  • Core ONT Services
  • Soluții standardizate, predefinite, cu un raport optim preț–performanță. Aceste servicii includ specificații clare privind tipul de analiză, parametrii tehnici, timpul de livrare (TAT) și costurile. Sunt disponibile opțiuni adiționale (add-ons), iar pentru multe dintre aceste servicii comenzile pot fi plasate direct prin platforma online, fără a fi necesară o ofertă preliminară.
  • Custom ONT Services
  • Soluții personalizate, dezvoltate pentru cerințe experimentale specifice. Înainte de plasarea comenzii, este furnizată o ofertă personalizată, care definește clar specificațiile serviciului, TAT-ul și costurile. Ulterior, comanda este procesată prin platforma online Microsynth.
  • Instrumente utilizate pentru secvențiere Oxford Nanopore (ONT)
  • ONT MinION
  • Secvențiator nanopore portabil, care permite generarea datelor în timp real, ideal pentru aplicații flexibile și proiecte cu necesități rapide de analiză. • Compact • Date în timp real
  • ONT GridION
  • Sistem de secvențiere nanopore multiplexat, potrivit pentru scalarea proiectelor și procesarea simultană a mai multor probe. • Scalabil • Cost-eficient
  • ONT PromethION 2 Solo / Integrated
  • Platformă de secvențiere de mare capacitate, concepută pentru proiecte genomice de amploare care necesită un volum mare de date. •  Puternic • Randament ridicat
  • Notă: Portofoliul de instrumente este actualizat periodic pentru a integra cele mai recente evoluții ale tehnologiei Oxford Nanopore (ONT). Pentru recomandări personalizate și detalii tehnice suplimentare, vă rugăm să contactați echipa Microsynth / ALA BIOLAB.
Vă rugăm să ne consultați referitor la cerințele privind trimiterea probele.
  • Ghiduri Full PlasmidSeq si Long PCRSeq
Flyer_FullPlasmidSeq.pdf
UserGuide_FullPlasmidSeq.pdf
  • Ghiduri BacterialSeq – Nanopore Bacterial Genome Sequencing
Flyer_BacterialSeq.pdf
UserGuide_BacterialSeq.pdf
  • Ghiduri BacterialSeq – Nanopore Bacterial Genome Sequencing
Flyer_nanoCORE_AmpliconMetagenomics.pdf
UserGuide_nanoCORE_Amplicon Metagenomics.pdf
UserGuide_NA_Isolation.pdf
Contactati-ne pentru o oferta sau pentru informatii suplimentare!
BITseq™ in comparație cu Sanger
Servicii Core ONT
Full PlasmidSeq
Descriere serviciu
Secvențiere ONT a plasmidelor circulare sau linearizate, BAC-urilor și fagilor, cu dimensiuni de până la 300 kb.
Material de intrare
ADN plasmidial sau colonii de E. coli (≥48 probe)
Rezultat analiză
Secvență consens anotată și rafinată, analiză a incertitudinii, etc.
TAT (Timp pana la rezultat)
1–2 zile lucrătoare
Long PCRSeq
Descriere serviciu
Secvențiere ONT a ADN-ului liniar clonal, cu dimensiuni între 600 bp și 300 kb.
Material de intrare
ADN
Rezultat analiză
Secvență consens anotată și rafinată, analiză a incertitudinii, etc.
TAT (Timp pana la rezultat)
1–2 zile lucrătoare
BacterialSeq
Descriere serviciu
Secvențiere ONT (cu sau fără rafinare Illumina) a genomurilor bacteriene, până la 12 Mb.
Material de intrare
ADN sau bacterii
Rezultat analiză
Secvență cromozomială consens anotată și rafinată, identificare de variante, etc.
TAT (Timp pana la rezultat)
≤7 Mb: 3–7 zile lucrătoare
nanoCORE Amplicon Metagenomics
Descriere serviciu
Secvențiere ONT a comunităților microbiene.
Material de intrare
ADN sau material pentru izolare
Rezultat analiză
Clustering OTU, profilare taxonomică, analiză de diversitate, etc.
TAT (Timp pana la rezultat)
ADN: ~2 săptămâniProbă originală: ~3 săptămâni
Servicii ONT Personalizate (Custom ONT Services)
Secvențiere AAV
Descriere serviciu
Secvențiere ONT a vectorilor AAV single-stranded sau self-complementary (scAAV).
Material de intrare
ADN (HMW) sau material pentru izolare
Rezultat analiză
Secvență consens rafinată, analiză de acoperire, clasificare rAAV, etc.
TAT (Timp pana la rezultat)
~5–10 zile lucrătoare
Secvențiere drojdii (Yeast Sequencing)
Descriere serviciu
Secvențiere ONT a genomurilor de drojdie, până la 20 Mb.
Material de intrare
ADN (HMW) sau material pentru izolare
Rezultat analiză
Secvență genomică consens rafinată și anotată, identificare de variante, etc.
TAT (Timp pana la rezultat)
~5–10 zile lucrătoare
Epidemiologie genomică (AMR, virulență etc.)
Descriere serviciu
Secvențiere ONT a genomurilor procariote.
Material de intrare
ADN (HMW) sau material pentru izolare
Rezultat analiză
Analiză detaliată a rezistenței antimicrobiene (AMR), factorilor de virulență, variațiilor genomice și reconstrucției plasmidelor.
TAT (Timp pana la rezultat)
~3–7 zile lucrătoare
Epidemiologie genomică (AMR, virulență etc.)
Descriere serviciu
Secvențiere ONT a genomurilor procariote.
Material de intrare
ADN (HMW) sau material pentru izolare
Rezultat analiză
Analiză detaliată a rezistenței antimicrobiene (AMR), factorilor de virulență, variațiilor genomice și reconstrucției plasmidelor.
TAT (Timp pana la rezultat)
~3–7 zile lucrătoare
Secvențiere de novo
Descriere serviciu
Secvențiere ONT de novo a genomurilor cu dimensiuni de până la 100 Mb.
Material de intrare
ADN (HMW) sau material pentru izolare
Rezultat analiză
Secvență genomică consens rafinată și anotată.
TAT (Timp pana la rezultat)
<30 Mb:="Mb:">
Resequencing
Descriere serviciu
Secvențiere ONT de tip resequencing pentru toate tipurile de organisme.
Material de intrare
ADN (HMW) sau material pentru izolare
Rezultat analiză
Identificare de variante și comparație genom vs. genom.
TAT (Timp pana la rezultat)
~1–3 săptămâni
Secvențiere CRISPR/Cas
Descriere serviciu
Secvențiere ONT a produselor PCR.
Material de intrare
ADN
Rezultat analiză
Analiză a editărilor CRISPR/Cas, inclusiv inserții și deleții de mari dimensiuni.
TAT (Timp pana la rezultat)
La cerere